Zut ! je ne vois que deux photos… c'est pas grave je pense comprendre quand même, vous me direz.
Pour boucher il faut suivre les indications dans le lien que je vous ai fourni dans ma précédente réponse ; réparer un stratifier ou le modifier c'est le même travail.
Si vous êtes sûr que votre carénage est époxy-carbone c'est un enduit avant peinture en principe mais effectivement sur la photo on voit nettement un décollement de la surface alors que le carbone dessous a l'air parfait qui est bien étonnant

Je suis un peu dubitative quand même sur ce coup. Ceci dit ça ne complique pas les modifications que vous voulez faire et vous ne pourrez pas utiliser de gel-coat qui ne se travaille qu'en moule.
Ponçage, nettoyage, réparations et pour la finition ça sera mastic ou enduit à voir puis peinture PU bi-composant.
Voyez les explications sur comment boucher un trou et revenez poser des questions si tout n'est pas clair.